Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fyco1Q8VDC1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fyco1Q8VDC1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Fyco1Q8VDC1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Fyco1Q8VDC1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Fyco1Q8VDC1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms