Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gle1Q8R322 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gle1Q8R322 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gle1Q8R322 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms