Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim29Q8R2Q0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim29Q8R2Q0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim29Q8R2Q0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms