Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr3Q8R191 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syngr3Q8R191 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngr3Q8R191 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr3Q8R191 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms