Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z0

Nod2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nod2Q8K3Z0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nod2Q8K3Z0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nod2Q8K3Z0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nod2Q8K3Z0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nod2Q8K3Z0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nod2Q8K3Z0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nod2Q8K3Z0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nod2Q8K3Z0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nod2Q8K3Z0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nod2Q8K3Z0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nod2Q8K3Z0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nod2Q8K3Z0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nod2Q8K3Z0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nod2Q8K3Z0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nod2Q8K3Z0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nod2Q8K3Z0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nod2Q8K3Z0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nod2Q8K3Z0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms