Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf219Q8K2Y0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf219Q8K2Y0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms