Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FntbQ8K2I1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FntbQ8K2I1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FntbQ8K2I1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms