Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c1Q8K284 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c1Q8K284 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf3c1Q8K284 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms