Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nek9Q8K1R7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nek9Q8K1R7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek9Q8K1R7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek9Q8K1R7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek9Q8K1R7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek9Q8K1R7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek9Q8K1R7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek9Q8K1R7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nek9Q8K1R7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek9Q8K1R7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek9Q8K1R7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek9Q8K1R7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms