Protein–RNA interactions for Protein: Q8K174

Tmem60, Transmembrane protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem60Q8K174 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tmem60Q8K174 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmem60Q8K174 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem60Q8K174 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem60Q8K174 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms