Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CopaQ8CIE6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CopaQ8CIE6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CopaQ8CIE6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms