Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh4a1Q8CHT0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh4a1Q8CHT0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh4a1Q8CHT0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms