Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx8Q8CFD4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx8Q8CFD4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx8Q8CFD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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