Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDT7

Cabcoco1, Ciliary-associated calcium-binding coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabcoco1Q8CDT7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabcoco1Q8CDT7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabcoco1Q8CDT7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cabcoco1Q8CDT7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms