Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
6030452D12RikQ8CD33 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms