Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RybpQ8CCI5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RybpQ8CCI5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RybpQ8CCI5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms