Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf31Q8CCF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf31Q8CCF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf31Q8CCF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms