Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrp11Q8CB67 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp11Q8CB67 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp11Q8CB67 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms