Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB49

Tprg1, Tumor protein p63-regulated gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1Q8CB49 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tprg1Q8CB49 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tprg1Q8CB49 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tprg1Q8CB49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms