Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms