Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933409G03RikQ8C5U0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms