Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp37Q8C0R0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp37Q8C0R0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms