Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef5Q8C0Q9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef5Q8C0Q9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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