Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx1bQ8BX32 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx1bQ8BX32 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Slx1bQ8BX32 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Slx1bQ8BX32 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Slx1bQ8BX32 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx1bQ8BX32 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx1bQ8BX32 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms