Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sall4Q8BX22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall4Q8BX22 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sall4Q8BX22 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms