Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk3Q8BWQ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dclk3Q8BWQ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dclk3Q8BWQ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclk3Q8BWQ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclk3Q8BWQ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk3Q8BWQ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk3Q8BWQ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms