Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp38Q8BW70 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp38Q8BW70 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp38Q8BW70 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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