Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVQ5

Ppme1, Protein phosphatase methylesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppme1Q8BVQ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppme1Q8BVQ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppme1Q8BVQ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppme1Q8BVQ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppme1Q8BVQ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms