Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc122Q8BVN0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc122Q8BVN0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc122Q8BVN0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc122Q8BVN0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms