Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUH1

Txnl4b, Thioredoxin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl4bQ8BUH1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Txnl4bQ8BUH1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Txnl4bQ8BUH1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Txnl4bQ8BUH1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Txnl4bQ8BUH1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms