Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUE1

Slc9a4, Sodium/hydrogen exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a4Q8BUE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a4Q8BUE1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a4Q8BUE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a4Q8BUE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a4Q8BUE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms