Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc18a2Q8BRU6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc18a2Q8BRU6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc18a2Q8BRU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc18a2Q8BRU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc18a2Q8BRU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc18a2Q8BRU6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc18a2Q8BRU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc18a2Q8BRU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc18a2Q8BRU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc18a2Q8BRU6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms