Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rd3Q8BRE0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rd3Q8BRE0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rd3Q8BRE0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rd3Q8BRE0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms