Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sfr1Q8BP27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfr1Q8BP27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfr1Q8BP27 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms