Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AtripQ8BMG1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AtripQ8BMG1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AtripQ8BMG1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms