Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tspan12Q8BKT6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan12Q8BKT6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms