Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcal1Q8BJL0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcal1Q8BJL0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcal1Q8BJL0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcal1Q8BJL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms