Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms