Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vipas39Q8BGQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vipas39Q8BGQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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