Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim6Q8BGE7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim6Q8BGE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim6Q8BGE7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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