Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efr3aQ8BG67 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Efr3aQ8BG67 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Efr3aQ8BG67 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3aQ8BG67 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms