Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Necab1Q8BG18 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Necab1Q8BG18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms