Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfascQ810U3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NfascQ810U3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfascQ810U3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NfascQ810U3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms