Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChfrQ810L3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChfrQ810L3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChfrQ810L3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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