Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdccag8Q80UF4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdccag8Q80UF4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdccag8Q80UF4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdccag8Q80UF4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdccag8Q80UF4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdccag8Q80UF4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdccag8Q80UF4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sdccag8Q80UF4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdccag8Q80UF4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms