Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

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Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC48.89■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC48.87■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC48.87■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC48.85■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC48.82■■■■■ 5.41
NischQ80TM9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC48.81■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
NischQ80TM9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC48.75■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC48.7■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC48.7■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC48.69■■■■■ 5.39
NischQ80TM9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC48.65■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.64■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC48.64■■■■■ 5.38
NischQ80TM9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.62■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC48.62■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC48.61■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC48.57■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
NischQ80TM9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC48.56■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.54■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC48.52■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.52■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC48.51■■■■■ 5.36
NischQ80TM9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.47■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.46■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
NischQ80TM9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms