Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna12Q80SS5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna12Q80SS5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms