Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ClmQ7TSN2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClmQ7TSN2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms