Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN73

Casd1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casd1Q7TN73 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casd1Q7TN73 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casd1Q7TN73 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casd1Q7TN73 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casd1Q7TN73 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casd1Q7TN73 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casd1Q7TN73 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casd1Q7TN73 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Casd1Q7TN73 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casd1Q7TN73 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casd1Q7TN73 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casd1Q7TN73 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casd1Q7TN73 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms