Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg4Q7TMD7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dsg4Q7TMD7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg4Q7TMD7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms