Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18,23■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vma21Q78T54 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18,2■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18,19■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,16■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18,15■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,15■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18,14■□□□□ 0,5
Vma21Q78T54 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18,11■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Vma21Q78T54 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms